Abhatoo - Centre Nationale de Documentation

Les oliviers cultivés et leurs parents sauvages, les oléastres, représentent deux variétés botaniques de l’espèce Olea europaea subsp. var. europaea et var. sylvestris, respectivement. Les études génétiques et archéobotaniques antérieures montrent l’existence de populations d’oléastres dans l’est et l’ouest du bassin méditerranéen avant le néolithique. La domestication de l’olivier aurait eu lieu dans au moins une de ces deux zones. Néanmoins, la lignée maternelle qui caractérise les oléastres de l’est de la Méditerranée est majoritaire au sein des variétés méditerranéennes. Une telle signature génétique est probablement le résultat de migrations humaines essentiellement d’est en ouest. En dépit de ces travaux, les origines et les processus de diversification à l’ouest de la méditerranée demeurent méconnus.
L’objectif de cette thèse est d’étudier les origines et les processus de diversification chez l’olivier à l’ouest de la Méditerranée. Deux hypothèses sont formulées: (i) une co-existence entre variétés sélectionnées localement et des variétés introduites à partir de l’est de la Méditerranée et maintenues par clonage, (ii) une sélection à partir des formes de l’est introgressées par les populations locales à l’ouest de la Méditerranée.
Dans une première partie, nous avons examiné les processus de diversification par une analyse des pratiques paysannes à une échelle localisée et dans une zone d’extrême diffusion, le Maroc. Il s’agissait de comprendre comment les paysans traitent la diversité variétale dans un contexte fortement impacté par une seule variété, la Picholine marocaine. Sur la base d’enquêtes semi-dirigées menées auprès des paysans dans les agro-écoystèmes traditionnels et selon une approche d’ethnobiologie, nous avons mis en évidence l’importance des logiques de classification locales qui sont reliées aux usages, à l’origine, à l’âge, au degré de conservation de l’huile, aux méthodes de propagation etc. et de l’impact de ces logiques sur le traitement, le maintien et la gestion de la diversité variétale. Nos résultats montrent la présence d’un système de dénomination basée sur des catégories englobantes où les types d’oliviers sont regroupés sous des noms génériques en fonction des critères socioculturels et techniques plutôt que sur des critères morphologiques. Nous avons montré que ces catégories sont définies par des contours permissifs permettant aux types d’oliviers d’être classés dans plusieurs catégories. Nous soutenons l'hypothèse selon laquelle ce système de classification permet de maintenir la diversité et constitue une force motrice pour la diversification variétale dans ces agro-écoystèmes caractérisés par une faible diversité variétale.
Dans une seconde partie, nous avons examiné les processus de diversification variétale par une approche basée sur la phylogéographie à l’échelle de la Méditerranée. Les analyses génétiques des variétés méditerranéennes d’olivier basées sur l’utilisation des marqueurs microsatellites nucléaires et chloroplastiques selon une approche bayésienne montrent une structure génétique est-ouest. La plupart des variétés de l’ouest de la méditerranée ont une lignée maternelle de l’est mais un génome nucléaire proche du "pool" génétique de l’ouest de la Méditerranée, ce qui indique une sélection à partir des formes de l’est introgressées par le "pool" génétique ouest. Nos résultats suggèrent en outre que la sélection des oliviers à partir d’arbres issus de graines, est un processus continu qui a été présent des les premières étapes de domestication jusqu’à nos jours. Nos analyses sur les pratiques paysannes montrent que l’oléastre issu de graines fait partie intégrante de l’agro-écosystème et fait l’objet de sélection et d’usage (greffage sur oléastre, utilisation de l'huile d’oléastre), ce qui plaide en faveur de l’hypothèse de l’introgression. En adoptant l’approche ABC (Approximative Bayesian Computation), nous montrons que le scénario basé sur l’introgression des oliviers de l’est par les oléastres de l’ouest est le plus probable.
Nous proposons un nouvel éclairage sur les processus de domestication à l’ouest de la Méditerranée en croisant les analyses des pratiques paysannes à celles de la phylogéographie de l’olivier dans le bassin méditerranéen. Nous discutons ces résultats vis-à-vis des approches de conservation ex-situ versus insitu et en rapport avec les questions soulevées par l’évolution de la diversité des plantes impliquant la multiplication végétative et la reproduction sexuée.